Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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