Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SGCAQ16586 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCAQ16586 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCAQ16586 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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