Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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