Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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