Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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