Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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