Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CBX2Q14781 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms