Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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