Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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PKP1Q13835 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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