Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HTR4Q13639 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms