Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CDH18Q13634 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CDH18Q13634 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CDH18Q13634 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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