Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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