Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HDAC1Q13547 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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