Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTGDRQ13258 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTGDRQ13258 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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