Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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