Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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