Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms