Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms