Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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