Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPREP23469 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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