Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRRM4A7MD48 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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