Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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HCN4Q9Y3Q4 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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HCN4Q9Y3Q4 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HCN4Q9Y3Q4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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