Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
USP35Q9P2H5 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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