Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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LTBP3Q9NS15 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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LTBP3Q9NS15 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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LTBP3Q9NS15 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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LTBP3Q9NS15 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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