Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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