Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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