Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms