Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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