Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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