Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms