Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SNCBQ16143 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SNCBQ16143 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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