Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms