Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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