Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SHPRHQ149N8 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SHPRHQ149N8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SHPRHQ149N8 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SHPRHQ149N8 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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