Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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COL19A1Q14993 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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