Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3AQ14563 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SEMA3AQ14563 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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