Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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SCARB2Q14108 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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SCARB2Q14108 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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SCARB2Q14108 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARB2Q14108 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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