Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CUL4AQ13619 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms