Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms