Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TCIRG1Q13488 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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