Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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TCOF1Q13428 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCOF1Q13428 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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