Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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SKP2Q13309 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SKP2Q13309 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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