Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms