Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRDM2Q13029 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PRDM2Q13029 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PRDM2Q13029 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRDM2Q13029 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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