Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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