Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRMP28827 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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