Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HCN4Q9Y3Q4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms