Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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LHX9Q9NQ69 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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