Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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