Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms